Dissimilar symmetric word pairs in the human genome

Ana Helena Tavares*, Jakob Raymaekers, Peter J. Rousseeuw, Raquel M. Silva, Carlos A.C. Bastos, Armando Pinho, Paula Brito, Vera Afreixo

*Autor correspondente para este trabalho

Resultado de pesquisarevisão de pares

1 Citação (Scopus)

Resumo

In this work we explore the dissimilarity between symmetric word pairs, by comparing the inter-word distance distribution of a word to that of its reversed complement. We propose a new measure of dissimilarity between such distributions. Since symmetric pairs with different patterns could point to evolutionary features, we search for the pairs with the most dissimilar behaviour. We focus our study on the complete human genome and its repeat-masked version.
Idioma originalEnglish
Título da publicação do anfitrião11th International Conference on Practical Applications of Computational Biology and Bioinformatics, 2017
EditoresMiguel Rocha, Juan F. De Paz, Tiago Pinto, Florentino Fdez-Riverola, Mohd Saberi Mohamad
EditoraSpringer Verlag
Páginas248-256
Número de páginas9
ISBN (impresso)9783319608150
DOIs
Estado da publicaçãoPublicado - 2017
Publicado externamenteSim
Evento11th International Conference on Practical Applications of Computational Biology and Bioinformatics, PACBB 2017 - Porto
Duração: 21 jun 201723 jun 2017

Série de publicação

NomeAdvances in Intelligent Systems and Computing
Volume616
ISSN (impresso)2194-5357

Conferência

Conferência11th International Conference on Practical Applications of Computational Biology and Bioinformatics, PACBB 2017
País/TerritórioPortugal
CidadePorto
Período21/06/1723/06/17

Impressão digital

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